[Gvsig_english] gvSIG and quick information: error message appears in gvSIG 1.11
Javier Estévez
jestevez at cartolab.es
Tue May 31 10:51:54 CEST 2011
Hi,
I'm not sure if this is related to Wolfgang's problem, but there may
be a issue with file management in gvSIG. It's easy to test, using
lsof command combined with wc to get open files: lsof -p pid | wc -l
(where pid is gvSIG's process identifier).
- gvSIG with one view and one layer on it: 674 open files.
- remove that layer from the view (this layer is not being used anymore): 673
- add the same layer: 676
- remove it again: 675
- and so on...
It seems that every time we add a layer in gvSIG (I'm always talking
about shp), it opens 3 files (I assume they are shp, shx and dbf), but
two of them are never closed. If you work with a lot of shapes, sooner
or later you'll get a "Too many open files" error. One of our projects
has 35 shape files loaded at once and it works well, but we can't
perform some processes without getting the error...
Best,
Javi
2011/5/31 Wolfgang Qual <Wolfgang.Qual at gmx.net>:
> Dear Cesar,
> thanks for your answer.
>
> You have hit the system or shell file handles limit. Look at this search
> for explanations and solutions about the problem:
>
> http://www.google.com/search?client=ubuntu&channel=fs&q=linux+Too+many+open+files&ie=utf-8&oe=utf-8
>
> This is related to the system, as the number of files (including sockets
> and other system handles) is limited globaly or per user. But it may be
> a gvsig problem if files or remote connections are not closed when not
> used anymore, or remain opened when not really needed.
>
> - Let me ask you some questions to try to know how how reached the
> opened files limit:
>
> - Do you have a gvsig project with a lot (I mean hundreds if not
> thousands) of layers? Or many gvsig instances?
> No, only _three_ layers: one wms- and two shapefile-layers. Only one gvSIG
> instance.
>
> - Are you using other programs at the same time as gvsig?
> of course: firefox, thunderbird, two other applications
>
> - Could you send us how many files opened has the gvsig process? To
> obtain it, for example in gnome, open the system monitor , right-click
> on the gvSIG java process and select the "show open files" menu option
> (it may take a while).
> On the command line, I could read:
>
> wolfgang.qual at rgu04-190:~$ lsof |grep java|wc -l
> 722
>
> A list of all files opened is attached to this message.
>
> What I did was the following
>
> 1) Open gvSIG, add the three layers
> 2) activated quick-info for the layer referate.shp
> 3) started the edit mode for "referate.shp"
>
> The error message pops up, logfile:
>
> DEBUG Thread-28 com.iver.andami.messages.NotificationManager - Can´t find
> file: /opt/uis/proj/referate/referate.shp
> in a driver: gvSIG shp driver
> Can´t find file: /opt/uis/proj/referate/referate.shp
> in a driver: gvSIG shp driver
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.drivers.shp.IndexedShpDriver.open(IndexedShpDriver.java:184)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.layers.VectorialFileAdapter.start(VectorialFileAdapter.java:106)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.edition.VectorialEditableAdapter.start(VectorialEditableAdapter.java:374)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.drivers.featureiterators.DefaultFeatureIterator.<init>(DefaultFeatureIterator.java:135)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.drivers.featureiterators.DefaultFeatureIterator.<init>(DefaultFeatureIterator.java:149)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.drivers.featureiterators.SpatialQueryFeatureIterator.<init>(SpatialQueryFeatureIterator.java:128)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.edition.VectorialEditableAdapter.getFeatureIterator(VectorialEditableAdapter.java:1082)
> at com.iver.cit.gvsig.fmap.layers.FLyrVect._draw(FLyrVect.java:399)
> at com.iver.cit.gvsig.fmap.layers.FLyrVect.draw(FLyrVect.java:636)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.DefaultMapContextDrawer.draw(DefaultMapContextDrawer.java:209)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.DefaultMapContextDrawer.draw(DefaultMapContextDrawer.java:175)
> at com.iver.cit.gvsig.fmap.MapContext.draw(MapContext.java:1097)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.MapControl$PaintingRequest.paint(MapControl.java:1043)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.MapControl$Drawer2$Worker.run(MapControl.java:1234)
> at java.lang.Thread.run(Unknown Source)
> Caused by: java.io.FileNotFoundException:
> /opt/uis/proj/referate/referate.shp (Too many open files)
> at java.io.FileInputStream.open(Native Method)
> at java.io.FileInputStream.<init>(Unknown Source)
> at
> com.iver.cit.gvsig.fmap.drivers.shp.IndexedShpDriver.open(IndexedShpDriver.java:159)
>
>
>
> Best regards,
> Wolfgang
>
>
> output.txt
> java 10906 wolfgang.qual cwd DIR 8,3 4096 11091970
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin
> java 10906 wolfgang.qual rtd DIR 8,3 4096 2
> /
> java 10906 wolfgang.qual txt REG 8,3 47308 1183234
> /test/gvSIG/jre/1.6.0_20/bin/java
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 0,0 0
> [heap] (stat: No such file or directory)
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 1041160 9191899
> /usr/lib/libcfitsio.so.2.510
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 4572544 9191901
> /usr/lib/libgdal.so.1.12.0
> java 10906 wolfgang.qual DEL REG 0,8 7405621
> /SYSV00000000
> java 10906 wolfgang.qual DEL REG 0,8 6324274
> /SYSV00000000
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 8388608 1049302
> /tmp/Geotools-1306825585921/Cached databases/EPSG.data
> java 10906 wolfgang.qual DEL REG 0,8 7372852
> /SYSV00000000
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 211130 1183055
> /test/gvSIG/jre/1.6.0_20/lib/i386/libjpeg.so
> java 10906 wolfgang.qual DEL REG 0,8 7077934
> /SYSV00000000
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 65927 11092395
> /test/gvSIG_1.11.0_final/libs/libz.so.1
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 909044 459424
> /usr/lib/libstdc++.so.6.0.8
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 138564 462022
> /usr/lib/libpng12.so.0.15.0
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 142078 11092866
> /test/gvSIG_1.11.0_final/libs/libjpeg.so.62
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 343712 462186
> /usr/lib/libtiff.so.4.2.1
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 126624 461832
> /usr/lib/libexpat.so.1.0.0
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 216356 9224641
> /usr/lib/libproj.so.0.5.0
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 91896 2558088
> /var/cache/fontconfig/365b55f210c0a22e9a19e35191240f32-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 22880 2557649
> /var/cache/fontconfig/945677eb7aeaf62f1d50efc3fb3ec7d8-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 20760 2557647
> /var/cache/fontconfig/6d41288fd70b0be22e8c3a91e032eec0-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 64328 2558087
> /var/cache/fontconfig/cabbd14511b9e8a55e92af97fb3a0461-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 5184 2558086
> /var/cache/fontconfig/e13b20fdb08344e0e664864cc2ede53d-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 258928 2557778
> /var/cache/fontconfig/eeebfc908bd29a90773fd860017aada4-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 258920 2557730
> /var/cache/fontconfig/21a99156bb11811cef641abeda519a45-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 108675 11092934
> /test/gvSIG_1.11.0_final/libs/libjgdal.so.0.9.2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 41096 12386414
> /lib/libgcc_s.so.1
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 67364 12386364
> /lib/tls/libresolv-2.3.6.so
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 17840 12386357
> /lib/tls/libnss_dns-2.3.6.so
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 7312 2557646
> /var/cache/fontconfig/de156ccd2eddbdc19d37a45b8b2aac9c-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 38372 12386358
> /lib/tls/libnss_files-2.3.6.so
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 1192 2557777
> /var/cache/fontconfig/bf1f9632594a1fa28e2cf4d7888deffe-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 7712 2557735
> /var/cache/fontconfig/b8613a33de00eecd32d5a94c3c617829-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 8888 2557776
> /var/cache/fontconfig/b21a91cee725896328b8cee8091cf747-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 14848 2557734
> /var/cache/fontconfig/fd9416c4b92f07c6f59a3a8cf496e9dc-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 1152 2557733
> /var/cache/fontconfig/059138ec877db160474b4d5de1248d14-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 10656 2557775
> /var/cache/fontconfig/8ab5f685cd6d8ba67c37c908faf08172-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 7592 2557732
> /var/cache/fontconfig/142ecfc435bad6f1fbc2648c1119d5eb-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 28394 11127863
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.sde/lib/org.gvsig.sde.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 27492 9191770
> /usr/lib/libungif.so.4.1.4
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 832463 1183103
> /test/gvSIG/jre/1.6.0_20/lib/ext/localedata.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 2240 2557731
> /var/cache/fontconfig/892f88ea27b235637f494d515247eddd-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 21528 2557774
> /var/cache/fontconfig/a960c40fc9306f090224a04585f8a963-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 14928 2557772
> /var/cache/fontconfig/9404ff413c67fc2a1526fd14eb4163a8-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 7360 2557773
> /var/cache/fontconfig/b3fedf7c409f006ca1a6fceffceb77cf-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 11608 2558084
> /var/cache/fontconfig/6330322105e0c4105d7c7a6ea2974107-x86.cache-2
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 35854 11126452
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.gpe/lib/org.gvsig.gpe.gui.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 561173 1082302
> /test/gvSIG/jre/1.6.0_20/lib/jsse.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 19970 11108724
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/dbf/dbf.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 5345 11108745
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/dbf/dbfWriter.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 14147 11108730
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/shp/shpWriter.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 58877 11108765
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/shp/shp.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 4014 11124739
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/odbc/odbc.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 9190 11124741
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/mysql/mysql.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 13075 11108763
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/dxf/dxfWriter.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 16893 11108734
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/dxf/dxf.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 4537 11091983
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/oracle/oracle.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 4314 11108752
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/csvstring/csvstring.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 2032 11108737
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/hsqldb/hsqldb.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 1993 11108748
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/postgresql/postgresql.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 48052 11108755
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/dgn/dgn.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 28319 11124743
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/dwg/dwg.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 91084 11108728
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/jdbc_spatial/oracle_spatial.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 1146137 1082293
> /test/gvSIG/jre/1.6.0_20/lib/resources.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 52191 11108770
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig/drivers/jdbc_spatial/jdbc_spatial.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 122782 11128019
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/es.iver.derivedGeom/es.iver.derivedGeom.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 85011 11127498
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig.annotation/lib/com.iver.cit.gvsig.annotation.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 157581 11126485
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig.wfs2/lib/com.iver.cit.gvsig.wfs2.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 352668 11128303
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/es.udc.cartolab.gvsig.navtable/lib/log4j-1.2.8.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 131198 11128296
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/es.udc.cartolab.gvsig.navtable/lib/es.udc.cartolab.gvsig.navtable.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 201062 11128304
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/es.udc.cartolab.gvsig.navtable/lib/miglayout-3.7.3.1.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 40656 11127938
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.selectionTools/org.gvsig.selectionTools.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 3238 11128335
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.consecutivenumber/org.gvsig.consecutivenumber.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 58171 11127992
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.quickInfo/org.gvsig.quickInfo.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 74890 11128359
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.newgeoprocess/org.gvsig.newgeoprocess.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 76716 11128202
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.tableImport/org.gvsig.tableImport.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 720702 11128165
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.tableImport/jxl-2.6.6.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 12279 11128340
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.copypastegeom/org.gvsig.copypastegeom.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 116934 11127459
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.gvsig.expressionfield/com.iver.gvsig.expressionfield.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 688101 11126898
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig.cad/com.iver.cit.gvsig.cad.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 137397 11126350
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.cit.gvsig.wms/com.iver.cit.gvsig.wms.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 31054 11128076
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.i18n/org.gvsig.i18n.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 24003 11128114
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.quickPrint/org.gvsig.quickPrint.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 11029 11127453
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/com.iver.gvsig.centerviewpoint/com.iver.gvsig.centerviewpoint.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 46792 11127902
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.tableSummarize/org.gvsig.tableSummarize.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 1356009 11127878
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.tableSummarize/swingx-2007_07_22.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 140545 11127899
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.tableSummarize/swing-layout-1.0.jar
> java 10906 wolfgang.qual mem REG 8,3 10538 11128200
> /test/gvSIG_1.11.0_final/bin/gvSIG/extensiones/org.gvsig.tableExport/org.gvsig.tableExport.jar
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> java 10906 wolfgang.qual 2w REG 8,3 92800 1033382
> /home/wolfgang.qual/.xsession-errors
> java 10906 wolfgang.qual 3r REG 8,3 46486155 1082292
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> /tmp/tmp-andami/wmsGetMap1306825826358
> java 10906 wolfgang.qual 329r REG 8,3 117028 1327715
> /usr/share/fonts/truetype/msttcorefonts/Arial_Black.ttf
> java 10906 wolfgang.qual 330r REG 8,3 2716012 1049321
> /tmp/tmp-andami/wmsGetMap1306825826358
> java 10906 wolfgang.qual 332r REG 8,3 247092 1327757
> /usr/share/fonts/truetype/msttcorefonts/Times_New_Roman_Italic.ttf
> java 10906 wolfgang.qual 333r REG 8,3 468380 493323
> /usr/share/fonts/truetype/ttf-dejavu/DejaVuSans-BoldOblique.ttf
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> java 10906 wolfgang.qual 335r REG 8,3 698236 1183092
> /test/gvSIG/jre/1.6.0_20/lib/fonts/LucidaSansRegular.ttf
> java 10906 wolfgang.qual 340r REG 8,3 425256 493307
> /usr/share/fonts/truetype/ttf-dejavu/DejaVuSansCondensed-Oblique.ttf
> java 10906 wolfgang.qual 341u sock 0,4 207870
> can't identify protocol
> java 10906 wolfgang.qual 343r REG 8,3 238612 1327756
> /usr/share/fonts/truetype/msttcorefonts/Times_New_Roman_Bold_Italic.ttf
> java 10906 wolfgang.qual 351r REG 8,3 832463 1183103
> /test/gvSIG/jre/1.6.0_20/lib/ext/localedata.jar
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> java 10906 wolfgang.qual 1022r REG 0,20 196 206246
> /opt/uis/proj/referate/referate.shx
> java 10906 wolfgang.qual 1023r REG 0,20 436 206244
> /opt/uis/proj/referate/referate.shp
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Javier Estévez Valiñas
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